Наступили мрачные 30-е годы, время повальных арестов священнослужителей, закрытия и разрушения храмов. В 1933 г. органы ОГПУ арестовали отца Дмитрия Вологодского. Его выслали в Нарымский край, но в 1934 г. освободили, и он был восстановлен в управлении епархией. В 1936 г. его рукоположили в сан архиепископа. Но в 1937 г. о.Дмитрий был вновь арестован и расстрелян в Минусинске. Один из надзирателей Минусинской тюрьмы указал верующим место общего захоронения расстрелянных, и тело Д.М.Вологодского было тайно перезахоронено на Минусинском кладбище.
В 30-е годы все пять Минусинских церквей были закрыты, а потом частично или полностью разрушены. Спасский собор явился единственным, сохранившим свой внешний облик. Но он был также закрыт для богослужений. В 1937 г. с него, как и с других храмов, были сняты колокола, а в следующем году в соборе устроили зерносклад. Только в 1943 г., оценив большой вклад церкви в борьбу с врагом, Сталин остановил разрушение храмов, во многих было возобновлено богослужение. Был восстановлен и Спасский собор, ставший единственной действующей церковью в городе. Главная заслуга в возвращении храма к жизни принадлежит бывшему священнику кладбищенской церкви, новому настоятелю собора Всеволоду Николаевичу Баркову, недавно вернувшемуся из лагерей Хабаровского края и Колымы, где он провёл 10 лет.
В.П.Лехов "Надежда" № 84(1374) 13 июня 2000 г. (газета, издаётся в Минусинске)